Stálé zastoupení v Bruselu je hlavním spojovacím článkem mezi českou administrativou a unijními orgány. Diplomaté Stálého zastoupení jednají na zasedáních 150 pracovních skupin, kterých v průběhu šesti měsíců bývá přes dva tisíce. Stálé zastoupení ve spolupráci s Úřadem vlády, Ministerstvem zahraničních věcí a ostatními resorty připravuje během jediného pololetí aktivity ČR na více než třech desítkách formálních rad ministrů a několika Evropských radách nejvyšších představitelů členských států. Evropské rady jsou hlavními orgány Unie, které určují směr jejího vývoje.

Všechna jednání ministrů v radách připravují dva výbory stálých představitelů při EU, takzvané COREPER II a COREPER I. První z nich se zabývá politickými, finančními a zahraničními tématy a ČR v něm zastupuje velvyslankyně při Edita Hrdá. Druhý se věnuje hlavně hospodářským a sociálním otázkám a zasedá v něm Jaroslav Zajíček, zástupce stálého představitele při EU. Třetím klíčovým výborem je Politický a bezpečnostní výbor, ve kterém jedná velvyslankyně Jitka Látal Znamenáčková.